Après cinq ans de développement, le CometChip®, plateforme de test de génotoxicité haut débit de TREVIGEN, a permis une augmentation de 5000% du nombre de données obtenues par rapport à la procédure d’origine du CometAssay.
Au cours de la validation de la plate-forme CometChip®, l’ensemble des laboratoires testeurs a fait des éloges à propos de la précision et la rapidité de l’analyse à haut débit.
Dans un laboratoire, 1.000.000 de comètes ont été analysées en deux semaines. Une performance jamais atteinte précédemment.
CometChip® : La solution à vos problèmes de Comet Assay
Le Comet Assay est connu en recherche comme la seule mesure directe des dommages à l’ADN et de sa réparation.
Cependant, l’adoption et l’utilisation systématique du dosage dans le criblage de sécurité pour les composés qui affectent la santé mais aussi l’environnement (médicaments, cosmétiques, produits chimiques, pesticides, fongicides…) a été entravée par des problèmes techniques, dont, la faible reproductibilité entre les tests, entre les laboratoires, ainsi que le manque de précision et le temps excessif requis pour une quantité élevée de tests.
Ces problèmes ont été résolus sur plusieurs années, par un programme de développement au cours duquel TREVIGEN a perfectionné le CometChip®.
CometChip®, la plate-forme haut débit, constituée de trois grands composants :
La technologie CometChip® Nanopore
Licence exclusive du MIT et développée par TREVIGEN.
Le CometChip® est un gel jetable contenant des milliers de nanopores de 30 microns, conçu pour capturer et compartimenter des cellules, attachées à une lame de verre spécialement traitée, indexées dans 96 puits.
La puce est placée dans un support qui positionne les puits de 6 mm de diamètre aux 96 emplacements indexés. Le support de puits est utilisé pour charger, laver et traiter les cellules dans le CometChip®.
Chaque puits de 6 mm contient environ 400 nanopores de 30 microns. Ces nanopores sont disposés selon un motif défini et une profondeur qui organise les cellules à tester sur un même plan. Cette fonctionnalité, ainsi que le champ électrophorétique très contrôlé dans le système d’électrophorèse Comet Assay® ES, empêche le chevauchement des comètes et permet la précision la plus élevée dans l’analyse de l’image.
Les réactifs Comet Assay®
Ils sont fabriqués et validés par TREVIGEN pour cette application.
Faits et testés par TREVIGEN, le tampon de Lyse et le LMAgarose sont réalisés avec des ingrédients de première qualité et testés pour obtenir une performance optimale du CometChip®.
Système d’électrophorèse CometAssay® (ES)
Système d’électrophorèse standardisé
Ce système d’électrophorèse à configuration unique a été conçu pour fonctionner soit en test de comètes standard soit en CometChip®. La quantité de tampon d’électrophorèse est prédéterminée et les électrodes sont positionnées de telle sorte que le champ électrique soit uniforme à chaque électrophorèse. Cette uniformité assure la reproductibilité entre électrophèses, entre unités d’électrophèses et entre laboratoires. En outre, le CometChip® est maintenu dans une orientation appropriée dans le champ électrophorétique par un plateau coulissant, qui assure que toutes les comètes auront l’alignement tête-à-queue appropriée pour l’analyse d’image sans difficulté. Contrairement à d’autres unités d’électrophèse sur le marché, le CometAssay ES de TREVIGEN a été conçu spécifiquement et uniquement pour les test des comètes.
Le logiciel d’analyse Comet
Ce programme est le plus rapide pour évaluer précisément les comètes, conçu par TREVIGEN
Si une moyenne de 208 comètes est disposée par puits, le CometChip® à 96 puits produit 20.000 comètes par puce. Avec une capacité de trois CometChips® par électrophorèse, le nombre de comètes par jour avec deux électrophorèses est de 120.000.
Le logiciel d’analyse de Comet de Trevigen peut analyser en quelques minutes ce qui auparavant prenait des jours.
Dans cet exemple, il est possible d’analyser 120.000 comètes, d’exporter des données et générer un rapport en moins de 20 minutes.
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